X档案第五季简介
【看点】：本季剧情逐渐升级，穆德和史考莉联手欺骗政府高层，潜入一处禁地，为了揭开殖民阴谋而与混血外星人展开激烈对抗。史考莉意外失去子宫，却诞生了弥留子艾蜜莉。两位知名科幻小说家特邀撰写剧本，其中一集更是喜剧风格。为配合电影上映，X档案增加了新角色和故事情节，揭示了“辛迪加”组织的阴谋，并让穆德再次接近真相。穆德的前女友的出现进一步考验了他与史考莉之间的关系。最终，吸烟人烧毁了所有X档案卷宗，本季剧情以此告一段落。
延续上一季的剧情，穆德和史考莉不得不用骗术欺骗政府高层，以便潜入一个对于普通FBI特别探员来说禁区的地方，以搜集必要的资料。整个行动展开后，他们发现一些混血外星人没有被彻底改造，他们联合起来抵抗殖民阴谋。然而，史考莉在被绑架时却遭到了不幸，她的子宫被移除，而令人匪夷所思的是，她的孩子——艾蜜莉，突然出现在了今年的故事中。
为了增加剧集的新鲜感，该季的制作团队特邀了两位知名科幻小说家参与创作，他们为剧集撰写了两集剧本，其中一集更是以喜剧的形式呈现。此外，为了配合即将上映的电影，X档案还引入了新的角色和情节。穆德再次接近真相，发现与“辛迪加”组织有关的阴谋日益清晰。而穆德的前女友的突然出现，则给他与史考莉之间的关系带来了重大考验。
本季剧情以吸烟人烧毁了所有X档案卷宗画上了句号。